
拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗原聚集MHC下列关于结合在一起肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫检测肽队列同时译文资料后绘制资讯,提高基因测序的真实度,并采用De novo从脚测序技木,不依赖现有数据库,更高些通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且丰富性的数据库定性分析信息内容为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!
图1 MHC-I和MHC-II呈递肺部肿瘤抗原的途经
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典型案例探讨
01 管理机制学习
散文主题 :The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells
发表文章杂质:Science Advances IF:11.7 2024
XPO1 (Exportin-1/CRM1)不是种核打印输出核蛋白,在癌症晚期中总是过呈现,做以为癌肿情况的驱动程序影响。近年,靶向治疗XPO1的小分子结构正被当做医学治癌药剂。作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫细胞肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。
图2 另外一种起源XPO1的肽是KIR2DS2的配体
02 淋巴肿瘤-免疫性改善
小文章大题目:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors
收录异物:Nature Communications IF:16.6 2023
恶劣胸膜间皮瘤(MPM)不是种愈后不合格品的肉瘤样癌性肺部肿瘤。致使主要的诊治细则不足辽效,因急切必须要 必须要 新的诊治策咯。由于其T血细胞浸泡,小说作者统计假设MPM不是个适合的诊治性癌证役苗的梦想。迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用研究背景质谱的免疫力肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。
图3 恶变胸膜间皮瘤免疫性肽组学判断
03 细菌病毒mRNA役苗设计
好的文章主题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes
投稿报纸:Nature Communications IF:16.6 2023
单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过依据质谱的免疫抗体肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。
图4 在李斯特菌感梁的Hela受损血细胞和HCT-116受损血细胞中检验MHC I呈递的抗原肽。
拜谱个人总结
免役体細胞系统力血体細胞肽组学是脂肪酸质组学的同一个快发展方向的分支节点,它致力于论述免役体細胞系统力血体細胞程序中由一般组识相溶性包覆体(MHC)或人类白血体細胞抗原(HLA)原子呈递的免役体細胞系统力血体細胞肽。这免役体細胞系统力血体細胞肽是血体細胞表面层呈递的肽段,能被T血体細胞分辨,最终得以闪避免役体細胞系统力血体細胞现象。立于质谱的免役体細胞系统力血体細胞肽组学已当上检验会MHC脂肪酸呈递肽的金标准规定具体方法,能可以检验会的与众不同人体生理和方面的问题睡眠状态下的与众不同组识和血体細胞品类中的免役体細胞系统力血体細胞肽组,列如 线下实体瘤或hiv病毒染上的血体細胞。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的淀粉酶组学、产生组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫性肽组探测服务质量,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,能够精确性且一直提供数据免疫检测系统肽编码序列,发掘其他非明显免疫检测系统肽,一层层挑选出靠谱新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。
选取论文
1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y