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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 系统临床药理学具体分析草酸钙肾结石防氧化应激性和支原体感染受伤机理

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿体系里常有的患病中的一个。肾策划 中CaOx氯化钠晶体过是处于饱和状态形成了会存在肾小管神经细胞直接损伤和凋亡,然后存在肾结石的形成了。短链多余脂肪细胞酸由消化道内厌氧反应器革兰氏阴性菌发醇饮食营养纤维棉存在,不光在产品局部消化道天然屏障中起着用,还在体系情况上也起着的关键用。另外,丁酸是最多的短链多余脂肪细胞酸,拥有消除炎症和免役仰制用,本调查论述丁酸对CaOx肾结石的用及隐性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山医疗泌尿美容外科吴忠硕士生导师、周子健硕士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教援、周子健医学博士在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物制品与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了在线药剂学学服务的,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

软文称呼:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 企业组织:华山醫院 研究探讨关键字:大鼠、HK-2肿瘤细胞 排列新信息:對照组(Con)、绘图组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱带来了方法:网路药剂学学检查

一个构想方法图

科研結果

科研的人员首选在校园营销推广活动的环节之中所构建大鼠模式,凭借内分泌系统生物化学指数公式和机构病理报告学脱色等科研法律手段察觉到丁酸不错降低CaOx模式大鼠肾CaOx结晶的成型和问题,改善CaOx模式大鼠的慢性炎症问题和阳极氧化的东西的过重表达方式。再者,丁酸还可仰制草酸成脂的HK-2血細胞问题、阳极氧化的应激状态和血細胞凋亡。 为的研究丁酸设计类型和靶染色体网,的研究者从PubChem得到丁酸和丁酸酯的二维和三维空间设计类型(图1A)。采用PharmMapper数值库和Uniprot数值库正确处理后共建立出117个丁酸靶染色体供进一点定性分享。将染色体所有接入STRING数值库,来PPI网定性分享。Cytoscape如下了顺序排列的前20的核心靶染色体的简略网图,是指CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。此类核心染色体与网中的另外染色体均最主要的的表现出千万的有关的性,就说明此类染色体有机会起到着协效应途。GO和KEGG定性分享阐释了丁酸核心染色体的有关的经过和生物技术体学基本功能(图1C)。核心染色体最主要的的与类固醇雌激素类回应、脱色应激反應性回应、可溶性氧癌细胞对类固醇雌激素类有趣的响应包括对咸性生物技术学产物的响应有关。由此可见根据上述,此类核心染色体最主要的的操作了脱色应激反應性和对可溶性氧的生物技术体响应环节,是肾结石转变成系统中至关注重的经过,这体现了丁酸有机会在肾结石中起到注重用途。

图1| 丁酸形式与靶基因组网洛数据分析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一部生命的进化丁酸对CaOx肾结石真的切靶人类表观遗传,探索考生完成GEO数据资料浅析库对GSE73680中稳定对比与CaOx肾结石爱美者的人类表观遗传不同完成了探索。对比组与CaOx结石爱美者的有关系数性不同把你想表现出来人类表观遗传(DEGs)选择标准化为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个人类表观遗传发现有关系数变现,这之中3379个(89.4%)人类表观遗传把你想表现出来上涨,404个(10.6%)人类表观遗传把你想表现出来下降(图2A)。对DEGs完成聚类分析法浅析浅析,热图显示信息了前10个被选中DEGs的二维层次结构聚类分析法浅析功能(图2B)。后来,探索考生完成GeneCards数据资料浅析库劳动力认定了370个会与CaOx肾结石有关的人类表观遗传,自然排名前20位的预測人类表观遗传和其有关性评级所显示2C所显示。从而找寻到丁酸治療CaOx肾结石的最为关键的靶点,探索考生将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石有关人类表观遗传处理获得一个多个Venn图。最中,CYP2C9被制定为丁酸反应CaOx肾结石的自身靶点(图2D)。凡此种种,探索考生还完成了丁酸与CYP2C9的碳原子挂接,CYP2C9的5个有机酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸相互间帮助,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在灵活运用无线网络药理学学預测CYP2C9是丁酸关系CaOx肾结石的靶表观遗传后,探索员还完成生殖神经元工作得知了CYP2C9可消减草酸诱导型的HK-2生殖神经元的ROS平行、支原体感染挤压伤和凋亡。

图2| 往往据库联和讲解预计CYP2C9是丁酸功效于CaOx肾结石的靶染色体

实验结局

本学习前提是发展丁酸在身体外和里面均能减弱CaOx肾结石模板的氧化的反应应激反应性和疾病受伤,然后经由手机电脑网络药剂学学淘汰得以丁酸影晌CaOx肾结石的不确定性靶点——CYP2C9,最后一个经由内部实践确认CYP2C9在草酸盐引发的HK-2内部ROS质量、疾病受伤和凋亡。这种发展说明丁酸很有可能经由减弱CYP2C9来减弱CaOx肾结石的氧化的反应应激反应性,消除疾病受伤。某一方式中拜谱海洋海洋生物带来了手机电脑网络药剂学学的技木的服务性,除此以外拜谱海洋海洋生物可加快稳定完美的染色体组学、营养物质质组学、产生组学等多个学成品及的技木的服务性,邀请拨打了解! 参考资料期刊论文:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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