
近日,武汉医科高校第一次附屬医院门诊王学浩院土团队图片在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,血清互作组和靶向疗法体力细胞代谢检测分析服务。
英语翻译小标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文字幕标题文字:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
用户政府部门:南京医科大学
论述素材:细胞
拜谱提供数据服务培训:转录组测序+蛋白质互作组+靶向疗法人体脂肪新陈代谢组
能力风格:
深入分析没想到
01、YBX1被司法鉴定为HCC中糖酵解的至关重要基因遗传
本调查数据表格了解采集HCC肉瘤模板(n=7)的单人体受损上皮细胞RNA测序数据表格了解集对其进行了解,会发现糖酵解催化活性大部分聚集在肉瘤人体受损上皮细胞中,hdWGCNA了解辨别的出9个人类基因输出模块(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的经营了解确立YBX1为独立的经营风险存在基本要素(图1H)。进步运用IHC、WB调查和肉瘤公司与相邻非肉瘤公司的余地转录组学数据表格了解集印证YBX1是肝人体受损上皮细胞癌缓解的自身靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被断定为缓解HCC神经细胞糖酵解的主要缘由
02、YBX1推动HCC中的有氧糖酵解和繁衍
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗势能分泌组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1推进HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
03、OGT与YBX1依照并有利于促进YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1融入并加速YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化开展其磷碱化,因此促使其核转位
进第一大步查重YBX1的O-GlcNAc糖基化可否关系其磷碱化,在OGT敲低的HCC生殖细胞核中或用OGT阻止剂OSMI-1解决,YBX1球核蛋白质品质相关系数降低了,YBX1磷碱化相关系数减轻(图4A-C)。IP實驗表现,在一样的的Flag-YBX1底物品质下,YBX1-WT的磷碱化品质相关系数高过YBX1-T57A,体现了磷碱化的添加不实际上仅是会因为越来越高的YBX1球核蛋白质表答(图4D)。隔离了核和质酚类化合物遇到TMG解决的HCC生殖细胞核中YBX1核表答的增大(图4E-F),进第一大步遇到YBX1磷碱化的关键所在调指数公式是AKT(图4G-I)。这一些遇到指出O-GlcNAc糖基化经由可以淡化其磷碱化来资料YBX1球核蛋白质不稳定义性并可以淡化核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 掩盖有益于其进这一步形成磷酸性反应掩盖并就能力促其核转位
05、YBX1推动PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1促进会PKM2转录
06、YBX1 能够增进组核蛋白乳碱化呈现水平方向
研发知道YBX1敲低可观下滑血清质乳碱化,尤为是H3K18乳碱化(图6A-C)。糖酵解仰药物制剂2-DG的实践查证了糖酵解与组血清乳碱化的一直连接,仰制糖酵解可可观下滑H3K18la水平面(图6D)。PKM2过表现可逆转转YBX1敲低所至的H3K18la下滑,以外源乳酸处理不加强H3K18la,还周期性YBX1表现调涨,提示卡长期存在同向反馈体制(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR查证,H3K18la实现丰度于YBX1运行子一直催进其转录,该具体步骤受O-GlcNAc糖基化自我调节(图6H-J),并知道P300 调涨是YBX1不断增强H3K18乳酰化做用的体制(图6K-L)。
图6.YBX1减弱H3K18乳酸性反应表达品质
经典文章个人总结
在这一种钻研中新闻了YBX1在HCC中高形容,然后与糖酵破译切有关系的。YBX1在T57处被O-GlcNAc表达爱,关键在于固定核膳食纤维并加强其形容。此类表达爱还推动YBX1在T57处的磷过酸,推动其核易位。为此,这一种时候增强学习了糖酵解有关系的什么是DNA的转录并激发乳酸的会产生。因此,YBX1启用P300的转录,继而推动组核球蛋白的乳过酸,尤为是H3K18la,H3K18乳过酸同向控制YBX1什么是DNA转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观基因正反两面馈环共识机制图
拜谱总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物制品为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向治疗电能产生组技术服务,拜谱生态学建立了完善成熟的转录组学、血清组学、译成后体现组学、细胞代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
符合论文毕业论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.