代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
组分签定：分解率组学系统能够对中葯中的药剂学反应组分参与全方面剖析，签定出药草中的吸附性组分。举例说明，凭借研究背景质谱（MS）的分解率组学系统，能够签定出山参中的山参皂苷等吸附性组分。在这种系统还能够分清中西药和非中西药那部分的药剂学反应标记图片物，为中葯的产品品质有效控制给出证据。
安全性能把握：经过分泌率组学技木，就能够对草药的安全性能做出开展和把握。譬如，合理利用藤本常绿植物分泌率组学概述，就能够发展真对类风湿病性骨骨关节炎的草药有效材料的安全性能标记符号的参考值策略。还有，分泌率组学还就能够辨别草药中的毒副作用有效材料十分毒副作用体制，如经过UPLC-Q-TOF-MS论述，判别多种乌头藤本常绿植物的催化有效材料，并辨别具备有镇痛药灵活性和呼吸功能衰竭毒副作用的生物学碱。
2. 中药药效机制研究
用处靶点甄别：新陈代谢组学技术应用能否的帮助甄别中西药活性氧基本成分的大分子靶点。如，探析看见雷公藤红素可实现调理Treg/TH1和Treg/Th17稳定性、阻挡NF-κB径路等规则展现免疫抑制用处。
用处工作新缘由诠释：新陈细胞分解率组学系统也能阐明成药制疗疫情的用处工作新缘由。举例说明，钻研知道青蒿素抗药性与疟原虫的线粒体新陈细胞分解率增加关干，非靶点新陈细胞分解率组学阐明了与该时候相关的新陈细胞分解率物发生改变。另外，新陈细胞分解率组学还可不可以能够 数据分析新陈细胞分解率物的发生改变，钻研成药复方的用处工作新缘由。
3. 中药安全性评价
毒素制度探讨探讨：分泌组学枝术可能使用在探讨探讨成药的毒素制度。假如，经过分泌组学和16S rDNA测序的优化具体分析，蕴含了清益汤对危重症突然胰腺炎一些突然肺受伤的保障制度，并敲定了铁镇定自若、地域差异分泌物和菌群工程菌群范围内的社会关系。
健康性风险评估报告：分泌组学的技术还能够 用以西药的健康性风险评估报告，甄别隐藏的的毒素成份和毒素靶点，才能为西药的健康利用出示学科措施。
4. 中医证候研究
证候相应的联排泄物讲解：排泄组学能力会适用于分析方法与中医理论师证候相应的联的内源性排泄物转变 ，辅助工具中医理论师证候的就诊和认知。列举，进行排泄组学探究，已在冠烦扰之处求美者中检验出与痰瘀证和和气气阴两虚证相应的联的怪物符号物。
证候干涉探索方案：细胞新陈代谢组学技術还会使代替探索方案中医学对中医学证候的干涉使用效果。诸如，凭借细胞新陈代谢组学技術及聚类算法研究分析法，会发现“黄芪-茯苓-泽泻”等关系性药配搭适使代替肾病整合征的新组方性药，并能对好几种肾病整合征有关的的海洋生物标准物引起损害。
5. 多组学技术整合应用
两组学整和：分解组学与其它组学方法（如基因遗传组学、转录组学、核蛋白组学等）的整和广泛应运，为药材茶实验保证半个个多基本要素的定性分析框架图。各种整和广泛应运一方面加剧了你们对药材茶组分在碳原子方面上对人体健康生理上和病理报告情形的导致，但是为探求药材茶的用途制度化和药用价值元素基础知识保证了强有效的辅助工具。
消化道消化道疾病疗法制度化：两组学系统能用以探索中药材疗法消化道消化道疾病的碳原子制度化。列举，能够 蛋白质酶质组学和分泌组学的协力拜谱生物，蕴含了与中医理论进行分类的膝膝盖骨性膝盖炎紧密联系涉及到的的差异性表现蛋白质酶和分泌通道。
新陈代谢组学的技术在西药科研中的采用，为西药的现时代化和精准定位医疗设备具备了更重要的完美搭载，利于力促西药的基准化和展览化进步。