
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱海洋生物 为其提供 TMT核蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研发报告
科研人工探究式渐渐冷库期限不断增多鸡肉的抗拉强度、持水、色调、游走子铁占比、ROS、脂质过钝化物、MDA、GSH和GPX4水准来鉴定力量组建组织上皮细胞的铁牺牲情况下。结局屏幕上显示,冷库期限不断增多后,鸡肉的抗拉强度在第8天和第6天重要骤降;持水力量减轻;色泽变深,失去了光泽感,鲜朱鲜红色转变成暗朱鲜红色。凡此种种,游走子铁、催化活性氧和MDA的占比重要增多,组织上皮细胞凋亡率重要增大。 理论研究人数拆分有一定的差异 保温周期的相关肌肉群试品的营养物质质,接下来做SDS-PAGE数据概述,营养物质质条带在有一定的差异 南北朝时期布局更加均匀且是类似的(图1a)。利用营养物质在有一定的差异 试品中的呈现环境,数据概述表明同样组试品的中数字更加接近于同样关卡(图1b),反映相关肌肉群试品营养物质质还具有更好的组内是类似的性和组间一定的差情人。 高蛋清质组学共评定结论出1996种高蛋清质。以B0为比组,建立B1、B2、B4和B6中的高蛋清采取相互影响表明深入数据分析,共评定结论到379个DEPs。将火山图可视化管理,并基于FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两种原则深入数据分析DEP。没想到长为1c-f如下,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别评定结论出22、33、73和140个DEPs,当中分刘海别调整6、11、32和89个,降低16、22、41和5俩。聚类分析方案测试了有异同 保鲜冷库环节腹肌阻止中高蛋清质的表明,没想到凸显腹肌高蛋清表明相互影响近年来保存周期的提升而提升(图1g)。
图1| 有所不同保鲜冷库时长的肌群印刷品蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不一样的冷冻时的相关肌肉样品英文之间的关系蛋白酶概述(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁身故蛋白酶肽的PRM降钙素原检测分析一下(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 应用场景KEGG丰度距离表达方式蛋清的铁阵亡策略(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物工程提供了TMT化学发光法血清质组学技能保障,拜谱生物工程已科研开发实现并设立了更加完善成熟期的转录组学、血清组学、新陈代谢组学及及两组学聯合车辆技能保障标准体系,欢迎致电咨询!
学习医学文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.